瑞金医院团队破解中国“癌王”患者特征( 三 )


修复缺陷型患者中位生存期为410天 , 而增殖活跃型和修复完备型则分别为197天和239天
(修复增强型患者的预后数据不足)


瑞金医院团队破解中国“癌王”患者特征
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患者的预后与四种亚型有关
依据这样的分型标准 , 研究人员在TCGA的胰腺癌患者数据中验证了他们在中国胰腺癌患者中的结论 。
首先他们发现 , 如果将TCGA的胰腺癌患者分为CNV-G1和CNV-G2两种类型 , 那么两种患者之间在CNV水平上有差异的基因仍然富集于HRR相关通路 。 接着 , 如果利用患者的CNV分数对TCGA的CNV-G1患者进行细分 , 则与之前的结果一致 , 这两种亚型之间的CNV水平差异基因富集于RTK通路 。 最后分析三种亚型
(修复缺陷型、增殖活跃型、修复增强型)
与预后的关系发现 ,
修复缺陷型患者的预后最好
(50%以上的患者在试验终点时仍然存活)

为了获得一个更直观的分类模型用于精准医疗临床指导 , 研究人员
选取了73个主要与DNA修复和RTK信号通路相关的基因 , 构建胰腺癌患者的分类模型

他们基于这个模型计算了患者的复发风险 , 并将患者分为了复发高风险和低风险两类 。 而且不论在训练集还是验证集中 ,
高风险患者的预后都更差
。 与预期一致的是 ,
低风险的患者大部分都是修复缺陷型


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利用73个基因构建的分类模型将患者分为复发高风险和低风险两类
最后 , 研究人员利用TCGA的数据分析了患者的复发风险与免疫微环境的关系 。 他们发现
低风险患者肿瘤中浸润的免疫细胞大都是有抗肿瘤活性的 , 例如效应记忆CD4T细胞、嗜酸性粒细胞;而在高风险患者的肿瘤中尽管也存在具有肿瘤杀伤性的免疫细胞 , 但这些患者的肿瘤还有与抗PD-1抵抗的转录组特征
, 表明高风险患者肿瘤中的杀伤性免疫细胞可能无法有效的发挥作用 。
总的来说 , 这个研究分析了608例中国胰腺癌患者的特定基因上的基因组突变谱 , 首次鉴定了四种与预后相关的胰腺癌分子亚型:修复缺陷型、增殖活跃型、修复完备型、修复增强型 , 并且构建了一个具有临床应用价值的患者复发风险评估模型 , 同时还更深层次的探究了患者复发风险差异背后免疫微环境异常 。 这对于指导临床治疗 , 特别是对于预后较差的修复完备型患者的治疗而言具有重大意义 。
参考文献:
[1]ChenW,ZhengR,BaadePD,etal.CancerstatisticsinChina,2015.CACancerJClin.2016;66(2):115-132.doi:10.3322/caac.21338
[2]ZhanQ,WenC,ZhaoY,etal.Identificationofcopynumbervariation-drivenmolecularsubtypesinformativeforprognosisandtreatmentinpancreaticadenocarcinomaofaChinesecohort[publishedonlineaheadofprint,2021Nov25].EBioMedicine.2021;74:103716.doi:10.1016/j.ebiom.2021.103716
[3]ParkW,ChenJ,ChouJF,etal.GenomicMethodsIdentifyHomologousRecombinationDeficiencyinPancreasAdenocarcinomaandOptimizeTreatmentSelection.ClinCancerRes.2020;26(13):3239-3247.doi:10.1158/1078-0432.CCR-20-0418
[4]PishvaianMJ,etal.Outcomesinpatientswithpancreaticadenocarcinomawith
geneticmutationsinDNAdamageresponsepathways:ResultsfromtheKnow
YourTumorProgram.JCOPrecisionOncology2019;3:1–10
[5]HeekeAL,PishvaianMJ,LynceF,etal.PrevalenceofHomologousRecombination-RelatedGeneMutationsAcrossMultipleCancerTypes.JCOPrecisOncol.2018;2018:PO.17.00286.doi:10.1200/PO.17.00286
瑞金医院团队破解中国“癌王”患者特征】[6]SinghiAD,GeorgeB,GreenboweJR,etal.Real-TimeTargetedGenomeProfileAnalysisofPancreaticDuctalAdenocarcinomasIdentifiesGeneticAlterationsThatMightBeTargetedWithExistingDrugsorUsedasBiomarkers.Gastroenterology.2019;156(8):2242-2253.e4.doi:10.1053/j.gastro.2019.02.037