为什么有些人感染新冠后病情更严重？新研究给出答案新型冠状肺炎

文章图片

为什么有些人的新冠肺炎病程比其他人更严重？由包括多伦多大学和伙伴医院的许多研究人员的国际合作创建的基因组序列数据库可能包含这个问题的答案，以及更多。
加拿大新冠肺炎人类宿主基因组测序数据库（称为CGEn HostSeq）的起源可以追溯到疫情的早期。
患病儿童医院（SickKids）的高级科学家、T大学数据科学研究所学术主任Lisa Strug表示，随着中国和全球其他地区出现新型冠状病毒的报告，遗传数据是她和其他研究人员在2019年底和2020年初的首要考虑因素。

Strug说，在我的研究中，我使用数据科学技术来绘制负责复杂特征的基因，他是T大学艺术与科学学院统计科学和计算机科学系以及达拉拉纳公共卫生学院生物统计学系的教授。
“我们知道基因是以前SARS感染严重程度的一个因素，因此由密切相关的病毒引起的COVID-19也具有遗传成分是有道理的。
很早就开始收到几位科学家的信息，他们希望建立不同的研究来帮助我们找到这些基因。
在接下来的几个月里，该中心是加拿大各地构成加拿大国家基因组测序基础设施CGEn的三个站点之一，他与来自联合国和合作伙伴医院和机构的近100名研究人员以及来自加拿大各地的其他研究人员合作，为新冠肺炎患者注册并对其基因组进行测序。
识别单个基因和复杂特征之间的关联通常需要数千个基因组——包括那些有该特征和没有该特征的基因组。虽然不乏可供选择的案例，但收集和测序DNA ，然后以对现在和未来的研究人员来说道德、高效和有用的方式组织数据至关重要。
Strug说，我们在数据科学研究所的关键任务之一是开发技术和程序，确保数据尽可能开放、可访问和可重复生产。
“当我们为该项目组装数据基础设施时，这一愿景得实现——例如，确保同意书尽可能广泛，以便这些数据可以与其他来源联系起来，从电子医疗记录到其他健康数据库。
“我们想确定，即使在新冠肺炎疫情结束后，这也可以是一个全国性的全基因组测序资源，可以询问有关健康和我们基因的各种问题。该数据库的开发及其开放性也使加拿大能够与其他国家的类似项目有效合作。 ”
最后，该项目收集了来自加拿大各地的11000多个完整基因组序列，代表了具有广泛健康结果的患者。结果发布在BMC基因组数据中。然后，根据所谓的COVID-19宿主遗传学倡议，这些数据与其他国家患者的更多序列相结合。
没过多久，模式就开始出现了。 2021年发表在《自然》杂志上的一篇论文确定了13个与SARS-CoV-2感染或COVID-19严重表现相关的全基因组重要位点。
从那时起，添加了更多的数据，随后的分析证实了现有基因座的重要性，同时也确定了新的基因座。今年早些时候在《自然》杂志上发表的该项目的最新更新使不同、全基因组的重要位点总数达到51个。
Strug说，识别这些基因座可以帮助人们预测谁可能更容易患严重的新冠肺炎病程。
“当你确定与特征相关的轨迹时，你还可以解开这个遗传区域导致COVID-19疾病的机制。这可能会确定未来药物可以围绕的治疗目标和方法。 ”

虽然需要很多年才能完全解开已确定的不同基因座的影响，但Strug表示，该数据库已经在以其他方式显示其价值。她说，很难找到具有全基因组序列的数据集，并被批准与其他如此大的健康信息联系起来，我们希望人们知道，通过一个完全独立的数据访问委员会，它是开放且可用于新冠病毒以外的各种研究。