1985年，他调到中医研究院基础理论研究所工作，专门从事医理研究。此后6年间，他几乎全年无休，全身心扑在中医基础理论研究上。“那6年里，我把有文字记载以来的历代医书，都翻阅了一遍。”他说，“遴选是个艰苦的过程！我从中挑选出300多部有价值的书籍，都是有关‘治则’的一些不错的书籍。”
“光靠上班时间是不够的，我晚上和节假日都去加班。因为是下班时间，电梯都关了，我只能爬楼梯上下楼。”周超凡说。令人欣慰的是，他有关治则研究的著作，很受欢迎，目前已经加印了5次。
在这个领域，周超凡深耕了几十年。通过对治则治法理论的整理与系统研究，他发表了10余篇高水平的学术论文，出版了《历代中医治则精华》《中医治则学》等4部中医专著，初步完成了中医治则治法体系的框架构建，开辟了一条实验、理论与临床相结合的研究路径。
周超凡退休后，仍然心系中医，先后开设了28次专题讲座。他还将诗歌修辞与中医药文化相结合，主编的科普图书《精彩诗图话中药》《精彩诗图话方剂》相继问世。日前，第二届全国名中医名单公示，凭着多年来在中医药领域的潜心钻研，周超凡入选公示名单。回望60多年的从医路，周超凡说：“传承中医，要干就干一辈子，关键是要坚持探索与研究中医临床和实验相结合的道路。”

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