磁珠法提取动物组织RNA 如何判断提取质量?

核酸提取传统方法传统的提取方法主要有酚/氯仿抽提法和硅胶柱法 , 这些传统提取方法可从不同组织样本中分离出DNA和RNA 。 但这些技术中包含沉淀和离心等操作步骤 , 其所需的生物样本量较大 , 提取步骤较为繁杂、费时费力 , 得率也不高 , 难以实现自动化操作 。
另外 , 大部分的传统方法中还需要用到有毒化学试剂 , 对操作人员的健康具有潜在危害 , 因此 , 伴随着分子生物学以及材料学的发展 , 采用磁珠的方法从液相系统中分离纯化核酸的新方法已经崛起 。
一、磁珠法提取
(一)磁珠法提取原理:
磁珠法提取动物组织RNA 如何判断提取质量?
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(二)传统核酸提取法和磁珠法比较:
磁珠法提取动物组织RNA 如何判断提取质量?
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二、如何评估磁珠法提取RNA的效果?
这里给出两个评价尺度:RNA纯度和RNA完整性 。
(一)RNA纯度判断
该指标通常用吸光度比值A260/A280和A260/A230来衡量 。 其中 , A260nm是核酸最高吸收峰的吸收波长 , A280nm是蛋白和酚类物质最高吸收峰的吸收波长 , A230nm是碳水化合物最高吸收峰的吸收波长 。
纯DNA的A260/A280比值为1.8 , 纯RNA为2.0 。 如果比值低 , 表示受到蛋白(芳香族)或酚类物质的污染 , 需要纯化样品 。 当A260/A280<1.8时 , 溶液中蛋白或者其他有机物的污染比较明显;当A260/A280>2.2时 , 说明RNA已经水解成单核酸了 。
纯DNA和RNA的A260/A230比值为2.5 。 若A260/A230<2.0 , 表明样品被碳水化合物(糖类)、盐类或有机溶剂污染 , 需要纯化样品 。
所以当1.8<A260/A280<2.2 , A260/A230比值为2.5时 , RNA纯度高 。
(二)RNA完整性判断
分离完整的RNA在基因表达分析所用的众多技术中是必不可少的 。 Northern分析 , cDNA文库构建以及用于微阵列芯片分析的cDNA标记实验(尤其在使用oligo(dT)作为引物时)均要求RNA具有高度的完整性 。
完整的总RNA在进行变性凝胶电泳时会产生清晰的28S和18SrRNA条带(真核样品) 。 28SrRNA条带的强度应当大致为18SrRNA条带的两倍 , 这种2:1的比率(28S:18S)是判断RNA完整性的一个很好的指标 , 证明所提取的RNA未降解 , 完整性好 , 可用于后续试验 。
部分降解的RNA样品电泳条带会弥散 , 没有清晰的rRNA条带 , 或者不会出现前面提到的高质量RNA才具有的2:1比率(28S:18S) 。 完全降解的RNA会表现为在极低分子量处的弥散状 。 电泳中加入RNA分子量标志物可以帮助确定条带或弥散对应大小 , 也可以帮助判断电泳是否正确进行 。
三、凡知组织RNA提取试剂盒
(一)产品特性
磁珠法提取动物组织RNA 如何判断提取质量?
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※RNA纯度高(OD260/2801.8-2.0);
※高收率 , 无降解;
※无高分子量DNA污染(DNaseI处理);
※适用多种样本类型;
※手工操作时间短;
(二)结果展示
1、紫外分光光度计浓度测定
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2、琼脂糖凝胶电泳图
(三)应用范围
纯化RNA适用于RT-PCR、RNA-Seq、芯片分析、分子克隆 。 返回搜狐 , 查看更多
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