作者:百趣代谢组学
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发表期刊:NatureCommunications
影响因子:12.353
发表时间:2019年
合作单位:第三军医大学附属西南医院
今天百趣代谢组学将给大家分享NatureCommunications上的一篇文章:ABHD5bluntsthesensitivityofcolorectalcancertofluorouracilviapromotingautophagicuracilyield 。
百趣代谢组学分享 , 氟尿嘧啶(Fu)是最常用的治疗直肠癌(CRC)的药物 。 然而因药物抗性 , 极大限制了其治疗的疗效 。 自噬(macroautophagy)是一种细胞分解代谢过程 , 自噬有潜力为附近所有代谢途径供能 , 为细胞提供巨大的代谢可塑性 。 代谢重编程和代谢酶的异常活跃被认为是恶性肿瘤的特征之一 。
作者证明ABHD5定位于溶酶体后与PDIA5相互作用 , 防止PDIA5与RNASET2相互作用 , 从而使RNASET2失活 。 代谢组学分享 , 它会损害RNASET2介导的自噬尿嘧啶产量 , 促进结直肠癌细胞将FU作为外源尿嘧啶摄入 , 从而增加其对FU的敏感性 。 研究结果首次揭示了ABHD5在调节溶酶体功能中的新作用 , 对基于FU辅助化疗后的机体恢复提供了重要见解 。
ABHD5降低了CRC细胞对FU的敏感性
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图1ABHD5降低了CRC细胞对FU的敏感性
采用癌症药物敏感性基因组学数据集 , 将ABHD5表达水平与化疗结果相关的敏感性数据集集合起来 , 通过Pearson’scorrelations的分析方法 , ABHD5表达在pMMR和dMMRCRC细胞系中都和IC50呈现正相关(图1a) 。 代谢组学分享 , 相比较与正常的癌细胞 , ABHD5基因敲除的细胞(ABHD5KD)在FU处理下IC50 , 细胞活力显著降低(图1b-c) , 细胞凋亡率显著升高(图1d) 。
随后作者做了小鼠实验 , 通过生物发光成像和TUNEL染色 , 得到同样的结论 , ABHD5KD组小鼠对FU处理后肿瘤负荷明显减小(图e) , 并且组织中肿瘤细胞凋亡率增加(图f) 。 代谢组学分享 , 对不同的小鼠做ABHD5基因敲入和敲除后 , 用PBS或FU处理 , 每隔一段时间给小鼠和肿瘤组织称重 , 发现ABHD5KD+FU处理组明显病情得到缓解(图1g-h) 。 再通过Caspase-3对凋亡细胞或Ki67对增殖细胞做免疫组化检测 , 也得到相同的结论ABHM5KD+FU处理明显抑制了细胞的增值并表现较强的敏感性(图1i-j) 。
FU辅助的化疗效果受ABHD5表达量影响
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图2ABHD5的表达以及FU辅助化疗的疗效
将NCBI-GEO数据集中361名CRCs患者分为ABHD5high组(262例)和ABHD5low组(99例) , 统计结果显示ABHD5high可能是BRAF阳性突变(BRAFMT) , p53野生型(p53WT)和染色体不稳定阴性型(CIN-)(图2a-b) 。 只用FU治疗的ABHD5high效果较好 , 有化疗的还是ABHD5low组更好(图2c-d) 。 代谢组学分享 , 用另外一组大数据量进行验证 , 也是同样的结果 , ABHD5low组更适合FU+化疗(图e-f) 。
ABHD5通过提高自噬性
尿嘧啶的产量来控制FU的摄取
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图3ABHD5影响CRC细胞对FU的摄取
通过HPLC发现ABHD5KD细胞中FU浓度增加 , WB显示PBS或者FU处理的正常癌症细胞中都没有发现TS,TP,DPD(这3个酶控制FU代谢)的变化 , 可能是FU浓度和药物吸收能力相关(图3a-b) 。 代谢组学分享 , 但是FU处理后 , ABHD5KD细胞尿嘧啶减少(图3c) , 但是尿嘧啶生物合成限速酶CPSII和UMPS没有发生变化(图3d) 。 ABHD5可能通过其他的方式影响了尿嘧啶的产量 。
在GSE38832数据集122例CRCs , ABHD5low组溶酶体途径相关基因是下降的(图3e) , 根据数据做了个热图 , 猜想溶酶体RNA的降解使得细胞产生了自噬 , 从而提高了尿嘧啶的含量(图3f) 。 HCS分析显示自噬体的量和FU的含量呈现负相关趋势(图3g-h) 。 代谢组学分享 , ABHD5过表达的细胞在FU和靶向药物处理后 , 才使得胞内尿嘧啶和FU的浓度提高(图3i-j) 。 在PDX模型中BECN1激活剂对ABHD5KD中的尿嘧啶和FU的浓度影响不是很大(图3k-l),说明ABHD5通过其他途径调节细胞自噬 。
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