疗法|粪菌移植太粗放，精准调菌有5招( 二 ) 细菌|微生物|研究|移植|患者

他的团队对晚期黑色素瘤患者的肠道微生物组也进行了分析，此次分析使用了 Microbiotica 公司自己研发的基因组测序方法。结果显示，有 9 种细菌富集于对免疫疗法有响应的患者体内[7] 。更为重要的是，使用这些细菌在四个独立队列中预测患者反应的准确率高达 91% 。
Robinson 说：“这些细菌的丰富程度似乎对患者是否有免疫反应有很大影响。 ”
Robinson 认为，服用由 9 种细菌组成的细菌联合体 MB097 ，将会使无反应患者更有可能从抗 PD-1 治疗中获益。而且，与已显示出治疗希望的基于 FMT 的方法相比[8-9] ，使用MB097可能更具针对性和有效性。
Robinson 宣称，与在短时间内有效的 FMT 疗法不同， MB097 可以通过每天给药，将有益细菌长期维持在高浓度水平。他的团队计划在 2023 年进行一项临床I期试验，将 MB097 与抗 PD-1 联用，用于治疗六个月内免疫治疗无效的晚期黑色素瘤患者。
Robinson 说，对于这些患者， “我们希望能够改变他们疾病的发展轨迹” 。

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招数3:CRISPR基因编辑技术其他研究团队则倾向于避免可能破坏肠道微生物组微妙平衡的行为，包括引入或去除细菌群落。
总部位于巴黎的 Eligo Bioscience 公司对更温和的方法感兴趣。该公司专门从事基因治疗方法的研究，通过工程噬菌体衣壳向肠道微生物提供 DNA 有效载荷。当具有治疗作用的 DNA 有效载荷到达靶标，它们会使有害基因失效或使治疗相关蛋白质得以表达。
该公司的主要研发项目是 EB003 。这是一种噬菌体衍生的纳米颗粒，经过工程设计，可附着在表达志贺毒素的肠出血性大肠杆菌 O157:H7 上。这种大肠杆菌表达的毒素会破坏肠道内壁，导致血性腹泻。 5 岁以下的儿童尤其容易遭受这种感染，高达 15% 的患者会发展为可能危及生命的溶血性尿毒症综合征[10] 。
当工程化纳米颗粒接触到肠出血性大肠杆菌 O157:H7 后，其会输送一批编码 CRISPR-Cas 核酸酶的 DNA 和相应的引导 RNA ，使两个表达志贺毒素的基因失效，从而杀死该细菌。
EB003 在经表达志贺毒素的大肠杆菌感染的兔子模型中进行了测试。接受了 EB003 治疗的兔子的感染持续时间明显短于接受缓冲液治疗的对照组。
Eligo Bioscience 首席科学官 Edith Hessel 博士解释说：“EB003 可以缓解腹泻的症状，显著加快上皮细胞的恢复速度，并阻止毒素的释放。 ”
在 Hessel 博士看来， EB003 展示了选择性改变微生物群的优势。她解释说：“你不仅想杀死（有害的）细菌，你还要以一种非常特殊的方式杀死它，以保持其他大肠杆菌完好无损。 ”
招数4:“操控”微生物组的活性 Enterome 公司正在采用类似的更加温和的方法来改变肠道微生物组。这家总部位于巴黎的公司的一个团队正在专注于寻找肠道细菌分泌的小蛋白，这些蛋白与人类细胞因子或激素一样，可以影响肠道和其他地方的生理过程。
Enterome 公司的一个项目与溃疡性结肠炎有关，这是一种发生在结肠和直肠内壁的炎症。为了推进这项计划，该公司的科学家决定寻找能够自然诱导肠道免疫细胞分泌白细胞介素 -10 的蛋白质。白细胞介素 -10 是一种有效的免疫调节细胞因子，具有抑制炎症的作用。
该公司拥有一个“肠道细菌分泌小蛋白”数据库，这一数据库包含了约 2 万个来自数千人的肠道微生物组的小蛋白数据。 Enterome 公司的科学事务经理 Grégoire Chevalier 博士解释说：“该数据库可以用来筛选出能够在体外诱导人类单核细胞分泌白细胞介素 -10 的蛋白质。 ”