环状RNA(circRNA)是一种新兴的内源性非编码RNA(ncRNA) , 它们参与细胞增殖、粘附、凋亡和存活等多个生物学过程[1] 。
近年来 , circRNAs在肿瘤领域也获得了越来越多的关注 。 有研究表明许多 circRNA能促进细胞周期发展 , 抑制或诱导肿瘤细胞凋亡以及抑制血管生成等等[2] , 各种不同的circRNAs在肿瘤发生发展过程中起着不同甚至相反的作用 。
虽然越来越多的研究报道了乳腺癌、肺癌和结直肠癌中异常的circRNAs[3] , 但circRNAs在肿瘤细胞中的生物学功能、分子机制和环状模式尚不清楚 。 此外 , 还有研究提出circRNAs可以通过病理功能未知的外泌体分泌到循环中[4] , 且比线性RNAs更容易被分选进入外泌体 。 然而 , circRNAs的外泌体特异性分选机制也仍然完全未知 。
近日 , 来自 浙江大学张红河和中国药科大学来茂德领衔的研究团队 ,阐明了circRHOBTB3在结直肠癌(CRC)进展中的生物学作用、环化过程和分泌途径 , 这一结果发表在 Molecular Cancer 期刊上 。
他们发现 ,抑瘤circRHOBTB3通过外泌体被癌细胞排出 , 以维持结直肠癌细胞的活性 。 此外 , 他们还 设计了靶向circRHOBTB3的环状化和分泌元件的反义寡核苷酸(ASOs) , 用于CRC的治疗 。
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circRHOBTB3是宿主基因RHOBTB3转录后剪接和环状化而产生的一种circRNA 。 RHOBTB3作为Rho GTPase家族ATP酶 , 参与膜转运[5、6]和蛋白酶体降解[7] 。
先前的研究也表明circRHOBTB3在CRC、卵巢癌、胃癌和肝细胞癌(HCC)中作为肿瘤抑制circRNA 。 然而 , 它的循环模式和外泌体分泌途径并未被阐释 。
首先 , 研究人员分析了来自GEO数据库的12例CRC患者、21例HCC患者、32例胰腺腺癌(PAAD)患者和14例健康供体的血清外泌体的总RNA-seq数据 。
结果显示 ,许多circRNAs在肿瘤患者血清外泌体中的表达程度不同(图1A) , 但 在所有三种癌症来源的外泌体中 , 只有hsa_circ_0007444(circRHOBTB3)均表达上调(图1B) , 且其宿主基因RHOBTB3在三种肿瘤组织中的表达与正常组织相比均无显著性的增强(图1C) 。
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图1 不同类型癌症中ircRHOBTB3在患者血清外泌体中的表达情况
然而 , 对来自浙江大学医学院邵逸夫医院体检的18例CRC患者和16例健康供者的血清样本数据分析发现 , 与健康供者相比 ,circRHOBTB3在CRC组织中显著下调 , 而宿主基因RHOBTB3显著上调(图2左二) 。 而且 , 在69个CRC组织样本中检测到的circRHOBTB3的表达结果显示 ,circRHOBTB3水平较高患者的总生存期更好(图2右一) 。
图2 ircRHOBTB3在CRC组织中患者血清外泌体中的表达情况
于是 , 研究者不禁假设 , circRHOBTB3是否具有抑癌作用?
为了验证这一点 , 他们先确定了 CRC患者血清外泌体中的circRHOBTB3确实来源于肿瘤细胞而非基质细胞(图3A) , 且circRHOBTB3水平在来自NCM460细胞(正常的肠上皮细胞系)的外泌体中最低(图3B) 。 进一步在RKO、HCT116细胞(CRC细胞系)中过表达或敲低circRHOBTB3 , 结果表明 circRHOBTB3可以抑制细胞迁移和侵袭能力(图3C) 。
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图3 circRHOBTB3来源与功能的体外验证实验
并且 , 他们通过对circRHOBTB3敲除/重新表达细胞系RNA-Seq数据的分析 , 以及RT-qPCR验证发现 ,在circRHOBTB3敲除的细胞系中代谢、增殖和上皮间充质转化(EMT)通路相关基因显著上调 , 而circRHOBTB3的重新表达降低了这些基因的表达 。此外 , circRHOBTB3敲除的细胞系中ROS水平也显著升高 。
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