以下证据可以证明夫妻分居多年：
1、一方在外居住的房屋租赁合同；
2、双方签订的夫妻分居书面协议，一定是要书面的，口头协议必须对方承认；
3、一方向另一方发出的书面分居文书，最好是用快件性质邮寄 ， 在备注栏里注明“分居”，并且保留邮寄凭证 ， 从邮寄之日起到提起离婚期间属于夫妻分居时间；
4、双方来往的书信、电子邮件等能证明双方感情不和分居的事实 。
《民事诉讼法》第六十三条规定，证据包括：
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【夫妻分居多年怎么证明】证据必须查证属实，才能作为认定事实的根据 。

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