1、秦岭山系的大熊猫与四川大熊猫的分布区早在12000年前就已经相互隔离；
2、秦岭大熊猫在遗传基因方面更接近原始的祖先，而四川大熊猫则具有更快的进化速度；
【四川和陕西大熊猫的区别】3、四川亚种的头长近似熊，秦岭亚种的头圆更像猫，且具有较小头骨、较大牙齿 。在皮毛颜色方面，秦岭大熊猫胸斑为暗棕色、腹毛为棕色，而四川大熊猫胸斑为黑色、腹毛为白色 。也就是说，秦岭的大熊猫与其它山系的大熊猫在形态学方面已具有显著的差异，其结果与基因方面的差异相一致 。秦岭大熊猫与四川大熊猫在形态上的明显差异，使它看上去更漂亮 ，
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