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作者:解螺旋.小米
如需转载请注明来源:解螺旋·医生科研助手
·导语·
Pubmed是国际上公认的最具权威的生物医学文献数据库 , 检索文献用Pubmed , 一般人都知道 。不过解螺旋还是会经常收到读者关于Pubmed和文献检索各种各样的问题 , 今天咱们就一次性解决问题 , 把Pubmed的基本、高级和精准检索功能做个梳理 , 大家各取所需吧 。
基本检索功能
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呦 , 还不一样?对于输入Pubmed的多词词组 , 它会查询词组索引 , 如果查到相应词组会将其作为一个检索词来检索 , 如果没有查到相应词组 , 则将其拆分成单个词分别检索 。所以liver cancer lncRNA就相当于Liver AND cancer AND lncRNA , 我不想把词组分开咋办?可以通过以下方法:
加双引号:“liver cancer”“lncRNA”
加标段标识[tw]:liver cancer[tw] lncRNA
加短横线“-”:liver-cancer lncRNA
加截词符“*”:liver cancer* lncRNA
如果检索完毕你对这篇文章感兴趣 , 则直接点击进入即可:
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左边是文章摘要和作者信息等 , 右边两个红框是全文链接:
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LinkOut-more resources这里也可以链接到数据库哦:
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点击任意一个进入相应的数据库 , 会有pdf标识的链接 , 然后就能下载啦!
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查询的关键词类型大致可以分为:
词语(主题)检索:在检索框中直接键入英文单词或短语 , 大小写都可 。
著者检索:在检索框中键入著者姓氏全称和名字的首字母缩写 , 注意格式为:著者姓空格 名字首字母缩写" , 如施一公 , shi yg.
刊名检索:在检索框中键入刊名全称或medline形式的简称、ISSN号 , 例如:molecularbiology of the cell, 或mol biol cell, 或1059-1524 , 然后回车或点击Go,系统将在刊名字段检索 , 并显示检索结果 。
日期检索:在检索框中键入日期或日期范围 , 日期的录入格式为YYYY/MM/DD;如:1999/09/08;只用年份或年月 , 如:2000或1999/12 。
期刊子集(辑) 检索:检索词ANDjsubseta,如:neoplasm AND jsubseta 。可供检索的期刊子库有3种:Abridged Index Medicus(有120种重要核心期刊)、Dental和Nursing 。分别使用jsubseta,jsubsetd, jsubsetn进行限定 。
检索带文摘的记录:检索的格式为:检索词AND has abstract, 如:liver cancer ANDhas abstract 。要注意的是在1975年前出版的文章 , 其MEDLINE记录中没有文摘 。
布尔逻辑检索:PubMed系统允许使用布尔逻辑检索 , 只要在检索框中键入布尔逻辑运算符(AND , OR或NOT) 。具体使用时要注意的问题 , 详见上第2点所述 。
高级检索功能
如果你要是有所针对 , 特异性的搜索具体作者、杂志或者其他信息等 , 还可以进行更加高级的检索 , 高级检索技巧有两个入口:一个入口是通过搜索前的advanced进入 , 就在pubmed首页搜索框的下面 。
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这里有三个高级搜索选型:
1.是左侧的and or not选项 , 很好理解 。
2.是搜索框选型 , fieids , 选择你需要选择的搜索范围 。
3.是index索引 , 以cancer为例 , 点击list , 出现下图内容 , 可以很方便的选择子方向 , 这个选项可以大大的提高我们的检索效率 , 缩小工作范围 。
第二个功能入口:是我们搜索之后的界面 , 在左侧的选项 。
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还是以cancer为例 , 左侧出现了additional filter , 这里我们可以把我们需要的内容进行筛选 , 比如我需要找到临床试验类型的文章 , 就在article types 中点击clinical trial , 需要查看最近5年的文章 , 就选择publication data 5 years , 等等 。这个功能能够帮助我们快速的筛选出我们需要的文章类型 , 很好用 。
想要查看pubmed的检索的详细内容 , 可以点击右下侧的search details , 点击see more , 你将会看到pubmed的全部搜索信息 , 同时提供修改 。
精准检索功能
PubMed上找论文时 , 如果关键词好几个 , 由于单词间的空格键存在AND命令 , 导致明明要搜的是词组 , 搜索不是被放大就是缩小 , 很难检索到合适且关联度高的文 。例如 , 你想找和肠炎与肿瘤坏死因子相关论文 , 搜索关键词:Inflammatory bowel disease TNF 。结果如下:
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试试搜索关键词:IBD TNF
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如果还想要基因检测方向的呢?搜关键词:genetic test IBD TNF
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用简称缩写确实一下子就将目标范围缩小了好几倍 , 然而很多词汇并没有简称 , 而且由于单词间的空格存在AND命令 , 将多个关键词一起输入时很容易导致找不到 , 需要交集计算的太多啦!找个文献难不成还要先熟练一下搜索命令又是引号又是括号吗?当然不用啦 , 又不是程序员!
怎么才能快速搜到我想要的论文呢?别急 , 看看下面在基因检测方向怎样快速靶向定位的例子 , 你就一切都了然了 。
1、首先选择PudMed的使用工具下的临床资料(Clinical Queries)
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2、输入一级关键词”IBD”
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3、在左右两边的临床研究目录以及临床遗传学下选择范围 , 如病因、诊断、治疗、预后和临床预测指南等 。
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选择右下的see all , 回到PubMed主页 。
4、输入你的二级关键词:TNF , 根据你的需要选择排序方式 。例如 , 出版时间、关联度、杂志等 。选择很多年前的文章作为参考文献 , 数量就不能多!如果五年十年前的参考文献超过70% , 这是打算写给谁看呢?
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OK啦 , 你的目的达到了 。
除此之外 , 你也可以通过布尔(BOOLEAN)运算来提高你的效率 , 最常用的三种布尔运算即是AND,OR和NOT 。
AND提供的运算方式即不管所输入的两个关键词语并列列出 , OR则是将出现至少一个关键词的文章列出 , 这种运算在想将相似主题的文章罗列在一起时 , 十分有效 。NOT运算可以在你的检索范围内将某些不需要的部分除去 。
但是在使用的时候要特别注意 , 会有可能将一些你所需要的文章漏掉 。比如当你的检索词为LEAD POISONING NOT CHILDREN时 , 除了会删除掉那些仅讨论儿童的文章 , 同时也会删去那些同时讨论儿童及其他年龄组的文章 。
收尾:批量保存和打印文献
Pubmed建立的生物医学文献检索系统 , 免费文献比例有限 , 不过一般高校都会买数据库权限 , 大家在校园局域网内可以任性下载文献、了解领域内科研前沿 。检索好自己想要的文献 , 免不了要收藏保存 。打开Summary下拉菜单选择其中一种格式 , 然后点击Save键;要保存特定记录时 , 点击记录左边的选择框予以标记后 , 再点击Save键 。
使用浏览器的打印功能 , 即可把感兴趣的内容打印出来 。系统允许每页最多显示500条记录 。如果想打印成文本格式 , 请先点击Text键 , 然后再打印 。到这 pubmed检索的一些基本功能 , 了解更深入的功能请继续关注解螺旋 。
编后语:
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