不合法，延期复工或推迟复工属于《突发公共卫生事件应急条例》第31条规定的应急预案启动后所采取的有关控制措施 ， 企业应当遵守 。
【法律依据】
《突发公共卫生事件应急条例》第三十一条：应急预案启动前，县级以上各级人民政府有关部门应当根据突发事件的实际情况，做好应急处理准备，采取必要的应急措施 。
应急预案启动后 ， 突发事件发生地的人民政府有关部门 ， 应当根据预案规定的职责要求，服从突发事件应急处理指挥部的统一指挥，立即到达规定岗位，采取有关的控制措施 。
【企业未按规定延期复工是否合法】医疗卫生机构、监测机构和科学研究机构，应当服从突发事件应急处理指挥部的统一指挥，相互配合、协作，集中力量开展相关的科学研究工作 。
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