德尔塔奥密克|最早发现于法国的德尔塔奥密克戎重组变异如何？巴斯德研究所详解( 二 ) 重组|病例|异体|研究人员|谱系

这项研究中的法国所有XD病例都是有症状的，大多数报告的症状是头痛（61.1%），虚弱/疲劳（58.3%），咳嗽（44.4%），发烧（38.9%）和肌痛（33.3%）。 2例XD病例住院治疗，其中1例原因不明，但时间少于24小时，没有重症监护入院。
研究指出，目前报告的所有XD病毒都可能来自一个独特的祖先。他们分离出每个亲本谱系的代表性病毒，以及重组XD病毒，从而进一步证明了重组基因型。他们提到， 2021年12月27日在Ile-de-France采样的AY.4病毒与XD变异体德尔塔样区域具有100%的一致性， BA.1病毒与XD变异体的奥密克戎样区域具有100%的一致性。
在感染小鼠中表现不同于奥密克戎
与SARS-CoV-2原始毒株序列相比，奥密克戎的刺突蛋白上积累了广泛的突变。由于XD刺突蛋白携带BA.1的大部分特征变化，包括整个受体结合域(RBD) ，研究人员假设这一重组变异体可能具有相似的免疫逃逸特性。

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XD重组和免疫逃逸。
通过测试病毒对疫苗接种者血清的敏感性发现，与原始病毒相比，研究观察到血清对德尔塔的中和滴度仅小幅降低。相比之下， XD重组变异体和 BA.1在2剂疫苗后1个月或6个月的血清样本中几乎都没有中和。在第三剂免疫后1个月，滴度都高得多，不过与原始病毒相比，它们对 BA.1和XD的中和效率仍然降低8倍至10 倍。
【德尔塔奥密克|最早发现于法国的德尔塔奥密克戎重组变异如何？巴斯德研究所详解】研究团队认为，这些结果表明XD变异体显示出与BA.1相似的免疫逃逸特性，并进一步强化了刺突蛋白RBD表位在血清组中疫苗诱导的中和反应中的主要作用。
值得关注的是，与德尔塔相比，奥密克戎BA.1与较低的严重疾病风险相关。一致地， BA.1已被证明在啮齿动物模型中引起减毒疾病，包括在人ACE2 转基因 (K18-hACE2) 小鼠的高度敏感模型中。
研究团队对K18-hACE2 小鼠进行攻毒试验后发现，感染后3天 (dpi) 时，感染 BA.1或XD病毒的小鼠肺部病毒RNA水平相当，比感染AY.4的动物低3.7倍。相比之下， XD 感染小鼠鼻甲中的病毒载量比 BA.1 感染动物高8.5倍，仅略低于AY.4感染小鼠。在测量传染性滴度时注意到了类似的差异。
他们还在11天内监测了小鼠的体重减轻和疾病。与主要的德尔塔谱系一样， AY.4分离株导致体重减轻的疾病在感染后3天时加速， 7只小鼠中有6只在感染后7-9天时达到人道终点。 BA.1感染则与体重无关。对于XD 病毒，研究人员在感染后5天内的这一期间没有观察到体重减轻，但所有小鼠在第5天和第8天之间迅速恶化，并在第 9天死亡或不得不实施安乐死。
研究团队总结称，总之，这些结果表明德尔塔-奥密克戎XD重组变异体在K18-hACE2小鼠中有着不同于奥密克戎BA.1的临床特征。这进一步表明，该模型中 BA.1 的减毒表型不能仅视为与刺突蛋白的变化有关，需要进一步的实验来确定小鼠感染XD后表型的基础，并确定这与人类XD感染的关系。

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XD（绿）与德尔塔AY.4（蓝）、奥密克戎BA.1（黄）在K18-hACE2小鼠的表型差异。
研究团队还进一步研究了XD病毒复制适应性的潜在差异。他们以 1:1、1:9 或 9:1 的比例为K18-hACE2小鼠组接种了BA.1和XD病毒的混合物，并使用宏基因组测序来估计肺和鼻甲中病毒基因组在感染后3天时的比率。结果显示，虽然BA.1在肺中始终胜过XD重组变异体体，但在鼻甲中观察到相反的情况。